Забор испражнений производится сразу после самопроизвольного акта дефекации. Кал необходимо собрать из разных мест разовой порции в количестве 20 г в чистую, сухую, широкогорлую посуду из светлого стекла с крышкой.
Необходимо избегать загрязнения кала мочой, выделениями из половых органов.
Материал необходимо доставить в лабораторию в течение 2 часов после сбора. Допустимо перед доставкой в лабораторию хранить в холодильнике (но не более 8 часов).